巧克力囊肿主要是卵巢功能异常，有慢性炎症刺激以及内分泌失调等因素导致，一旦发现，那建议是手术治疗，可以采用宫腹腔镜手术保留卵巢切除子宫，要不然是会影响到卵巢正常的排卵，其次囊肿越来越大，容易引起病变，建议尽早治疗。