囊胚移植当天子宫内膜变薄0.1可能是由于反复的宫腔操作，造成的子宫内膜基底层受到损伤导的。子宫内膜环境也影响胚胎着床，子宫内膜是胚胎着床的场所，如果子宫内膜足够厚，血流丰富，细胞分裂良好，就会提高胚胎着床率，着床时间也比较快。但如果子宫内膜过薄，血流不足，内分泌不足，胚胎就不容易着床。因此，一定要以正常的心态对待这个问题，不要过度焦虑，保持乐观的情绪，有助于胚胎的及时着床。另外每个人的体格都不一样，所以在体囊胚移植后着床时间也不一样。
子宫内膜的生长主要依赖于雌激素的作用，可以补充雌激素来进行调理。如果效果不明显，则需尽量提高子宫内膜容受性，如雌激素药物、生长激素、针灸、理疗、宫内刺激、HCG宫内灌注等可作为辅助治疗方法。一般来说，经过一段时间的调理和治疗，过薄的子宫内膜会得到改善。平时放松身心，养成良好的规律生活习惯，适当补充营养，必要时去医院就诊治疗。在囊胚移植后10天及时去医院验血，判断是否怀孕成功。